本周《自然-通訊》發表的兩項獨立研究RAS-pathway mutation patterns define epigenetic subclasses in juvenile myelomonocytic leukemia和Genome-wide DNA methylation is predictive of outcome in juvenile myelomonocytic leukemia鑒定出了幼年型粒-單核細胞白血病(JMML)的三種新亞組,它們可以預測病人結局,包括最有可能發生疾病自行消退的病人。
無監督聚類分析揭示了JMML病人三個明顯的DNA甲基化亞組。
Stieglitz et al.
幼年型粒-單核細胞白血病(JMML)是一種惡性兒童癌癥,治療手段有限。目前的JMML臨床和遺傳標記沒有解釋與該疾病相關的不同臨床結果。DNA甲基化在該疾病中扮演著重要角色。兩項獨立研究表明,這一表觀遺傳標記或有助于解釋不同JMML病人的結果差異。
德國癌癥研究中心的Christoph Plass、Daniel Lipka及同事分析了167例JMML樣本的DNA甲基化模式和突變情況,發現了三個甲基化水平各不一樣(高、中、低)的亞組。甲基化水平高的病人,臨床結果差;甲基化水平低的病人,預后良好;所有三組的突變情況都不一樣,表明在JMML病人中,DNA甲基化機制的激活與突變模式存在關聯。美國加州大學舊金山分校的Elliot Stieglitz、Mignon Loh及同事研究了39名病人的DNA甲基化,獨立鑒定出三個DNA甲基化亞組,其中高甲基化水平與不良臨床結果相關,而低甲基化水平與良好預后相關;他們在另外40名病人身上驗證了這一點。
鑒定JMML特異性的DNA甲基化異常模式。
Lipka et al.
該研究為根據DNA甲基化劃分不同JMML患者奠定了基礎,有助于我們進一步了解JMML的基礎生物學機制。
NComms|doi: 10.1038/s41467-017-02178-9 NComms|doi: 10.1038/s41467-017-02177-w